Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfod1Q3UHD2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfod1Q3UHD2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfod1Q3UHD2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfod1Q3UHD2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfod1Q3UHD2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfod1Q3UHD2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfod1Q3UHD2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfod1Q3UHD2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfod1Q3UHD2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfod1Q3UHD2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfod1Q3UHD2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfod1Q3UHD2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfod1Q3UHD2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfod1Q3UHD2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfod1Q3UHD2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfod1Q3UHD2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfod1Q3UHD2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gfod1Q3UHD2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gfod1Q3UHD2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gfod1Q3UHD2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gfod1Q3UHD2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gfod1Q3UHD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gfod1Q3UHD2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfod1Q3UHD2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gfod1Q3UHD2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gfod1Q3UHD2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gfod1Q3UHD2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gfod1Q3UHD2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfod1Q3UHD2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gfod1Q3UHD2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gfod1Q3UHD2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gfod1Q3UHD2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gfod1Q3UHD2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gfod1Q3UHD2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gfod1Q3UHD2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfod1Q3UHD2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gfod1Q3UHD2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gfod1Q3UHD2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gfod1Q3UHD2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfod1Q3UHD2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gfod1Q3UHD2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gfod1Q3UHD2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gfod1Q3UHD2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gfod1Q3UHD2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gfod1Q3UHD2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gfod1Q3UHD2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gfod1Q3UHD2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gfod1Q3UHD2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gfod1Q3UHD2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfod1Q3UHD2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gfod1Q3UHD2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gfod1Q3UHD2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gfod1Q3UHD2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms