Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hdhd2Q3UGR5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hdhd2Q3UGR5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdhd2Q3UGR5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hdhd2Q3UGR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hdhd2Q3UGR5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hdhd2Q3UGR5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdhd2Q3UGR5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdhd2Q3UGR5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hdhd2Q3UGR5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hdhd2Q3UGR5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hdhd2Q3UGR5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdhd2Q3UGR5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdhd2Q3UGR5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hdhd2Q3UGR5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdhd2Q3UGR5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hdhd2Q3UGR5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hdhd2Q3UGR5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hdhd2Q3UGR5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Hdhd2Q3UGR5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hdhd2Q3UGR5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Hdhd2Q3UGR5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Hdhd2Q3UGR5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Hdhd2Q3UGR5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hdhd2Q3UGR5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Hdhd2Q3UGR5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hdhd2Q3UGR5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hdhd2Q3UGR5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdhd2Q3UGR5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Hdhd2Q3UGR5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Hdhd2Q3UGR5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hdhd2Q3UGR5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Hdhd2Q3UGR5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Hdhd2Q3UGR5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdhd2Q3UGR5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hdhd2Q3UGR5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hdhd2Q3UGR5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hdhd2Q3UGR5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdhd2Q3UGR5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdhd2Q3UGR5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdhd2Q3UGR5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hdhd2Q3UGR5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdhd2Q3UGR5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdhd2Q3UGR5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdhd2Q3UGR5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hdhd2Q3UGR5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hdhd2Q3UGR5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hdhd2Q3UGR5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdhd2Q3UGR5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hdhd2Q3UGR5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Hdhd2Q3UGR5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hdhd2Q3UGR5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdhd2Q3UGR5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Hdhd2Q3UGR5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hdhd2Q3UGR5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hdhd2Q3UGR5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hdhd2Q3UGR5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdhd2Q3UGR5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdhd2Q3UGR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdhd2Q3UGR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdhd2Q3UGR5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdhd2Q3UGR5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdhd2Q3UGR5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdhd2Q3UGR5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdhd2Q3UGR5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdhd2Q3UGR5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdhd2Q3UGR5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hdhd2Q3UGR5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms