Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnjQ3TZI6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnjQ3TZI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnjQ3TZI6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnjQ3TZI6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnjQ3TZI6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnjQ3TZI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnjQ3TZI6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjQ3TZI6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjQ3TZI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnjQ3TZI6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnjQ3TZI6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnjQ3TZI6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcnjQ3TZI6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcnjQ3TZI6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcnjQ3TZI6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcnjQ3TZI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcnjQ3TZI6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CcnjQ3TZI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcnjQ3TZI6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcnjQ3TZI6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnjQ3TZI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CcnjQ3TZI6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcnjQ3TZI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnjQ3TZI6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnjQ3TZI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnjQ3TZI6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnjQ3TZI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnjQ3TZI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnjQ3TZI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnjQ3TZI6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnjQ3TZI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnjQ3TZI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnjQ3TZI6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnjQ3TZI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnjQ3TZI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnjQ3TZI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjQ3TZI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnjQ3TZI6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnjQ3TZI6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnjQ3TZI6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnjQ3TZI6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjQ3TZI6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CcnjQ3TZI6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnjQ3TZI6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnjQ3TZI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnjQ3TZI6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnjQ3TZI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CcnjQ3TZI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CcnjQ3TZI6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CcnjQ3TZI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms