Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJB1

Zmym1, Zinc finger, MYM domain containing 1, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmym1Q3TJB1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Zmym1Q3TJB1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zmym1Q3TJB1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zmym1Q3TJB1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Zmym1Q3TJB1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zmym1Q3TJB1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zmym1Q3TJB1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zmym1Q3TJB1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zmym1Q3TJB1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zmym1Q3TJB1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zmym1Q3TJB1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Zmym1Q3TJB1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Zmym1Q3TJB1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zmym1Q3TJB1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zmym1Q3TJB1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Zmym1Q3TJB1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zmym1Q3TJB1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zmym1Q3TJB1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zmym1Q3TJB1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zmym1Q3TJB1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zmym1Q3TJB1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zmym1Q3TJB1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zmym1Q3TJB1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zmym1Q3TJB1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zmym1Q3TJB1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Zmym1Q3TJB1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zmym1Q3TJB1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Zmym1Q3TJB1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zmym1Q3TJB1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Zmym1Q3TJB1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zmym1Q3TJB1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zmym1Q3TJB1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zmym1Q3TJB1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zmym1Q3TJB1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zmym1Q3TJB1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zmym1Q3TJB1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zmym1Q3TJB1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zmym1Q3TJB1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zmym1Q3TJB1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zmym1Q3TJB1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zmym1Q3TJB1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zmym1Q3TJB1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zmym1Q3TJB1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zmym1Q3TJB1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zmym1Q3TJB1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zmym1Q3TJB1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zmym1Q3TJB1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zmym1Q3TJB1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zmym1Q3TJB1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zmym1Q3TJB1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zmym1Q3TJB1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zmym1Q3TJB1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zmym1Q3TJB1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zmym1Q3TJB1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zmym1Q3TJB1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zmym1Q3TJB1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zmym1Q3TJB1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Zmym1Q3TJB1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zmym1Q3TJB1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zmym1Q3TJB1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zmym1Q3TJB1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Zmym1Q3TJB1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zmym1Q3TJB1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zmym1Q3TJB1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zmym1Q3TJB1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zmym1Q3TJB1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zmym1Q3TJB1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms