Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mfsd2bQ3T9M1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mfsd2bQ3T9M1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mfsd2bQ3T9M1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mfsd2bQ3T9M1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mfsd2bQ3T9M1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mfsd2bQ3T9M1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mfsd2bQ3T9M1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mfsd2bQ3T9M1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mfsd2bQ3T9M1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mfsd2bQ3T9M1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mfsd2bQ3T9M1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mfsd2bQ3T9M1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mfsd2bQ3T9M1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mfsd2bQ3T9M1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mfsd2bQ3T9M1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mfsd2bQ3T9M1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd2bQ3T9M1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mfsd2bQ3T9M1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mfsd2bQ3T9M1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mfsd2bQ3T9M1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mfsd2bQ3T9M1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mfsd2bQ3T9M1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mfsd2bQ3T9M1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mfsd2bQ3T9M1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mfsd2bQ3T9M1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mfsd2bQ3T9M1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mfsd2bQ3T9M1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Mfsd2bQ3T9M1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mfsd2bQ3T9M1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mfsd2bQ3T9M1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mfsd2bQ3T9M1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mfsd2bQ3T9M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mfsd2bQ3T9M1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mfsd2bQ3T9M1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mfsd2bQ3T9M1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mfsd2bQ3T9M1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mfsd2bQ3T9M1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mfsd2bQ3T9M1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mfsd2bQ3T9M1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd2bQ3T9M1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd2bQ3T9M1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mfsd2bQ3T9M1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd2bQ3T9M1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd2bQ3T9M1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2bQ3T9M1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd2bQ3T9M1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mfsd2bQ3T9M1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mfsd2bQ3T9M1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd2bQ3T9M1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd2bQ3T9M1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd2bQ3T9M1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd2bQ3T9M1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mfsd2bQ3T9M1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd2bQ3T9M1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd2bQ3T9M1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd2bQ3T9M1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd2bQ3T9M1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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