Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccbe1Q3MI99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccbe1Q3MI99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccbe1Q3MI99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccbe1Q3MI99 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccbe1Q3MI99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccbe1Q3MI99 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccbe1Q3MI99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccbe1Q3MI99 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccbe1Q3MI99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccbe1Q3MI99 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccbe1Q3MI99 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccbe1Q3MI99 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccbe1Q3MI99 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccbe1Q3MI99 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccbe1Q3MI99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccbe1Q3MI99 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccbe1Q3MI99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccbe1Q3MI99 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccbe1Q3MI99 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccbe1Q3MI99 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccbe1Q3MI99 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccbe1Q3MI99 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccbe1Q3MI99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccbe1Q3MI99 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccbe1Q3MI99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccbe1Q3MI99 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccbe1Q3MI99 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccbe1Q3MI99 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccbe1Q3MI99 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccbe1Q3MI99 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccbe1Q3MI99 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccbe1Q3MI99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccbe1Q3MI99 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccbe1Q3MI99 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccbe1Q3MI99 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccbe1Q3MI99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccbe1Q3MI99 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccbe1Q3MI99 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms