Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rhox4cQ2MDG1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhox4cQ2MDG1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox4cQ2MDG1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox4cQ2MDG1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox4cQ2MDG1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox4cQ2MDG1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox4cQ2MDG1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox4cQ2MDG1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox4cQ2MDG1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox4cQ2MDG1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox4cQ2MDG1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox4cQ2MDG1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox4cQ2MDG1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhox4cQ2MDG1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhox4cQ2MDG1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rhox4cQ2MDG1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rhox4cQ2MDG1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rhox4cQ2MDG1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rhox4cQ2MDG1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhox4cQ2MDG1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhox4cQ2MDG1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox4cQ2MDG1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox4cQ2MDG1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox4cQ2MDG1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox4cQ2MDG1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox4cQ2MDG1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox4cQ2MDG1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox4cQ2MDG1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox4cQ2MDG1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rhox4cQ2MDG1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox4cQ2MDG1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox4cQ2MDG1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox4cQ2MDG1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox4cQ2MDG1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox4cQ2MDG1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rhox4cQ2MDG1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox4cQ2MDG1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox4cQ2MDG1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox4cQ2MDG1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox4cQ2MDG1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox4cQ2MDG1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox4cQ2MDG1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox4cQ2MDG1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms