Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Edem3Q2HXL6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Edem3Q2HXL6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Edem3Q2HXL6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Edem3Q2HXL6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Edem3Q2HXL6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Edem3Q2HXL6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Edem3Q2HXL6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Edem3Q2HXL6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Edem3Q2HXL6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Edem3Q2HXL6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Edem3Q2HXL6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Edem3Q2HXL6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Edem3Q2HXL6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Edem3Q2HXL6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Edem3Q2HXL6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Edem3Q2HXL6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Edem3Q2HXL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Edem3Q2HXL6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Edem3Q2HXL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Edem3Q2HXL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Edem3Q2HXL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Edem3Q2HXL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edem3Q2HXL6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Edem3Q2HXL6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Edem3Q2HXL6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Edem3Q2HXL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Edem3Q2HXL6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Edem3Q2HXL6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Edem3Q2HXL6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Edem3Q2HXL6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms