Protein–RNA interactions for Protein: Q14C10

Vmn1r15, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r15Q14C10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r15Q14C10 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r15Q14C10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r15Q14C10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r15Q14C10 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r15Q14C10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r15Q14C10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r15Q14C10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r15Q14C10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r15Q14C10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r15Q14C10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r15Q14C10 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r15Q14C10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r15Q14C10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r15Q14C10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r15Q14C10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r15Q14C10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r15Q14C10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r15Q14C10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r15Q14C10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r15Q14C10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r15Q14C10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r15Q14C10 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r15Q14C10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r15Q14C10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r15Q14C10 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r15Q14C10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r15Q14C10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r15Q14C10 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn1r15Q14C10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r15Q14C10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r15Q14C10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r15Q14C10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r15Q14C10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r15Q14C10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r15Q14C10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r15Q14C10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r15Q14C10 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r15Q14C10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r15Q14C10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r15Q14C10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r15Q14C10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r15Q14C10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r15Q14C10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 431.2 ms