Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cass4Q08EC4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cass4Q08EC4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cass4Q08EC4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cass4Q08EC4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cass4Q08EC4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cass4Q08EC4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cass4Q08EC4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cass4Q08EC4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cass4Q08EC4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cass4Q08EC4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cass4Q08EC4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cass4Q08EC4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cass4Q08EC4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cass4Q08EC4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cass4Q08EC4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cass4Q08EC4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cass4Q08EC4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cass4Q08EC4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cass4Q08EC4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cass4Q08EC4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cass4Q08EC4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cass4Q08EC4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cass4Q08EC4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cass4Q08EC4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cass4Q08EC4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cass4Q08EC4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cass4Q08EC4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cass4Q08EC4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cass4Q08EC4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cass4Q08EC4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cass4Q08EC4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cass4Q08EC4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cass4Q08EC4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cass4Q08EC4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cass4Q08EC4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cass4Q08EC4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cass4Q08EC4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cass4Q08EC4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cass4Q08EC4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cass4Q08EC4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cass4Q08EC4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cass4Q08EC4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cass4Q08EC4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cass4Q08EC4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cass4Q08EC4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cass4Q08EC4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cass4Q08EC4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cass4Q08EC4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cass4Q08EC4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cass4Q08EC4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cass4Q08EC4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cass4Q08EC4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cass4Q08EC4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cass4Q08EC4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cass4Q08EC4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cass4Q08EC4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cass4Q08EC4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cass4Q08EC4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cass4Q08EC4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cass4Q08EC4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cass4Q08EC4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cass4Q08EC4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cass4Q08EC4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms