Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gata4Q08369 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gata4Q08369 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gata4Q08369 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gata4Q08369 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gata4Q08369 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata4Q08369 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata4Q08369 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gata4Q08369 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gata4Q08369 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gata4Q08369 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gata4Q08369 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gata4Q08369 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gata4Q08369 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gata4Q08369 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gata4Q08369 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gata4Q08369 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gata4Q08369 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gata4Q08369 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gata4Q08369 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gata4Q08369 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gata4Q08369 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gata4Q08369 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gata4Q08369 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gata4Q08369 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata4Q08369 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata4Q08369 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata4Q08369 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gata4Q08369 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata4Q08369 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata4Q08369 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata4Q08369 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata4Q08369 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata4Q08369 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata4Q08369 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata4Q08369 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata4Q08369 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata4Q08369 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gata4Q08369 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gata4Q08369 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gata4Q08369 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gata4Q08369 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms