Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
GscQ02591 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GscQ02591 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GscQ02591 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GscQ02591 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GscQ02591 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GscQ02591 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GscQ02591 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GscQ02591 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GscQ02591 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GscQ02591 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GscQ02591 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GscQ02591 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GscQ02591 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GscQ02591 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GscQ02591 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GscQ02591 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GscQ02591 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GscQ02591 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GscQ02591 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GscQ02591 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GscQ02591 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GscQ02591 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GscQ02591 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GscQ02591 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GscQ02591 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GscQ02591 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GscQ02591 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GscQ02591 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GscQ02591 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GscQ02591 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GscQ02591 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GscQ02591 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GscQ02591 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GscQ02591 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GscQ02591 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GscQ02591 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GscQ02591 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GscQ02591 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GscQ02591 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GscQ02591 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GscQ02591 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GscQ02591 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GscQ02591 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GscQ02591 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GscQ02591 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GscQ02591 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GscQ02591 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GscQ02591 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GscQ02591 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GscQ02591 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GscQ02591 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GscQ02591 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GscQ02591 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GscQ02591 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GscQ02591 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GscQ02591 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GscQ02591 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GscQ02591 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GscQ02591 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GscQ02591 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GscQ02591 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GscQ02591 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GscQ02591 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GscQ02591 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GscQ02591 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GscQ02591 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GscQ02591 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GscQ02591 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GscQ02591 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GscQ02591 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GscQ02591 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GscQ02591 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GscQ02591 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GscQ02591 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GscQ02591 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GscQ02591 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GscQ02591 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GscQ02591 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GscQ02591 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GscQ02591 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GscQ02591 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GscQ02591 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GscQ02591 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GscQ02591 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GscQ02591 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GscQ02591 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GscQ02591 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GscQ02591 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GscQ02591 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GscQ02591 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GscQ02591 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GscQ02591 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GscQ02591 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GscQ02591 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GscQ02591 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GscQ02591 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GscQ02591 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GscQ02591 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GscQ02591 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms