Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gbp10Q000W5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gbp10Q000W5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gbp10Q000W5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp10Q000W5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp10Q000W5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp10Q000W5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gbp10Q000W5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gbp10Q000W5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gbp10Q000W5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp10Q000W5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp10Q000W5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gbp10Q000W5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp10Q000W5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp10Q000W5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp10Q000W5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp10Q000W5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gbp10Q000W5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp10Q000W5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp10Q000W5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gbp10Q000W5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp10Q000W5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp10Q000W5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gbp10Q000W5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gbp10Q000W5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gbp10Q000W5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gbp10Q000W5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gbp10Q000W5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp10Q000W5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp10Q000W5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp10Q000W5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gbp10Q000W5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp10Q000W5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp10Q000W5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp10Q000W5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp10Q000W5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gbp10Q000W5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp10Q000W5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp10Q000W5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp10Q000W5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp10Q000W5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp10Q000W5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gbp10Q000W5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp10Q000W5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp10Q000W5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp10Q000W5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gbp10Q000W5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.6 ms