Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps45P97390 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Vps45P97390 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps45P97390 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Vps45P97390 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Vps45P97390 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vps45P97390 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps45P97390 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps45P97390 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Vps45P97390 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps45P97390 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps45P97390 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Vps45P97390 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Vps45P97390 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Vps45P97390 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vps45P97390 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps45P97390 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vps45P97390 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vps45P97390 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vps45P97390 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vps45P97390 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vps45P97390 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vps45P97390 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vps45P97390 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps45P97390 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vps45P97390 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vps45P97390 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps45P97390 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps45P97390 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vps45P97390 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vps45P97390 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vps45P97390 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vps45P97390 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Vps45P97390 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Vps45P97390 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vps45P97390 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vps45P97390 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps45P97390 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vps45P97390 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vps45P97390 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vps45P97390 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vps45P97390 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vps45P97390 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Vps45P97390 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vps45P97390 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vps45P97390 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps45P97390 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Vps45P97390 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Vps45P97390 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vps45P97390 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps45P97390 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vps45P97390 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vps45P97390 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vps45P97390 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vps45P97390 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vps45P97390 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vps45P97390 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vps45P97390 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps45P97390 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vps45P97390 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps45P97390 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps45P97390 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vps45P97390 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Vps45P97390 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vps45P97390 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Vps45P97390 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vps45P97390 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Vps45P97390 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps45P97390 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vps45P97390 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vps45P97390 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vps45P97390 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps45P97390 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps45P97390 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps45P97390 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps45P97390 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Vps45P97390 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vps45P97390 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps45P97390 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vps45P97390 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vps45P97390 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vps45P97390 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Vps45P97390 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vps45P97390 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms