Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sfrp2P97299 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp2P97299 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp2P97299 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sfrp2P97299 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sfrp2P97299 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp2P97299 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sfrp2P97299 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sfrp2P97299 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sfrp2P97299 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfrp2P97299 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sfrp2P97299 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sfrp2P97299 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sfrp2P97299 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sfrp2P97299 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sfrp2P97299 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp2P97299 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sfrp2P97299 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sfrp2P97299 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfrp2P97299 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfrp2P97299 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfrp2P97299 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfrp2P97299 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sfrp2P97299 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sfrp2P97299 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfrp2P97299 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfrp2P97299 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sfrp2P97299 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sfrp2P97299 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sfrp2P97299 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sfrp2P97299 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp2P97299 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp2P97299 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp2P97299 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp2P97299 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp2P97299 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp2P97299 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sfrp2P97299 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sfrp2P97299 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfrp2P97299 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp2P97299 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp2P97299 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfrp2P97299 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms