Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tubb4bP68372 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tubb4bP68372 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tubb4bP68372 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tubb4bP68372 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tubb4bP68372 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubb4bP68372 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tubb4bP68372 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubb4bP68372 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tubb4bP68372 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubb4bP68372 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tubb4bP68372 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tubb4bP68372 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubb4bP68372 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tubb4bP68372 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tubb4bP68372 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tubb4bP68372 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tubb4bP68372 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tubb4bP68372 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tubb4bP68372 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tubb4bP68372 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tubb4bP68372 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubb4bP68372 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Tubb4bP68372 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tubb4bP68372 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tubb4bP68372 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tubb4bP68372 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tubb4bP68372 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tubb4bP68372 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tubb4bP68372 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Tubb4bP68372 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb4bP68372 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tubb4bP68372 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tubb4bP68372 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tubb4bP68372 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tubb4bP68372 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb4bP68372 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tubb4bP68372 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubb4bP68372 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubb4bP68372 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubb4bP68372 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubb4bP68372 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb4bP68372 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubb4bP68372 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubb4bP68372 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tubb4bP68372 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tubb4bP68372 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tubb4bP68372 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tubb4bP68372 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tubb4bP68372 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tubb4bP68372 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tubb4bP68372 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tubb4bP68372 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tubb4bP68372 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tubb4bP68372 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tubb4bP68372 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tubb4bP68372 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tubb4bP68372 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tubb4bP68372 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubb4bP68372 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubb4bP68372 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tubb4bP68372 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tubb4bP68372 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tubb4bP68372 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tubb4bP68372 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb4bP68372 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tubb4bP68372 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tubb4bP68372 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tubb4bP68372 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tubb4bP68372 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tubb4bP68372 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Tubb4bP68372 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tubb4bP68372 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tubb4bP68372 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tubb4bP68372 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tubb4bP68372 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms