Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps28P62858 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps28P62858 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps28P62858 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps28P62858 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps28P62858 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps28P62858 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps28P62858 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps28P62858 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps28P62858 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rps28P62858 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps28P62858 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rps28P62858 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps28P62858 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps28P62858 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps28P62858 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps28P62858 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps28P62858 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps28P62858 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps28P62858 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps28P62858 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rps28P62858 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps28P62858 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps28P62858 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps28P62858 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps28P62858 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps28P62858 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps28P62858 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps28P62858 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps28P62858 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps28P62858 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps28P62858 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps28P62858 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps28P62858 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps28P62858 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps28P62858 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps28P62858 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps28P62858 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps28P62858 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms