Protein–RNA interactions for Protein: P61215

Ca10, Carbonic anhydrase-related protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca10P61215 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca10P61215 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ca10P61215 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ca10P61215 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca10P61215 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca10P61215 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ca10P61215 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca10P61215 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ca10P61215 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ca10P61215 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ca10P61215 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ca10P61215 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ca10P61215 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ca10P61215 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ca10P61215 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ca10P61215 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ca10P61215 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ca10P61215 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ca10P61215 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ca10P61215 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ca10P61215 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ca10P61215 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ca10P61215 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ca10P61215 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ca10P61215 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca10P61215 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca10P61215 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca10P61215 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ca10P61215 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ca10P61215 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca10P61215 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca10P61215 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ca10P61215 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ca10P61215 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca10P61215 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ca10P61215 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ca10P61215 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ca10P61215 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ca10P61215 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca10P61215 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca10P61215 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca10P61215 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ca10P61215 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca10P61215 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca10P61215 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ca10P61215 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca10P61215 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca10P61215 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca10P61215 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca10P61215 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca10P61215 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca10P61215 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ca10P61215 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ca10P61215 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca10P61215 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca10P61215 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ca10P61215 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ca10P61215 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ca10P61215 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ca10P61215 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ca10P61215 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ca10P61215 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ca10P61215 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ca10P61215 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ca10P61215 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ca10P61215 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ca10P61215 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ca10P61215 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ca10P61215 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ca10P61215 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ca10P61215 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ca10P61215 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ca10P61215 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ca10P61215 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ca10P61215 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ca10P61215 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ca10P61215 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms