Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b6P59708 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b6P59708 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b6P59708 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sf3b6P59708 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sf3b6P59708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sf3b6P59708 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b6P59708 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sf3b6P59708 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sf3b6P59708 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sf3b6P59708 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sf3b6P59708 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sf3b6P59708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sf3b6P59708 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sf3b6P59708 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b6P59708 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sf3b6P59708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b6P59708 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sf3b6P59708 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sf3b6P59708 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sf3b6P59708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3b6P59708 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3b6P59708 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b6P59708 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b6P59708 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b6P59708 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b6P59708 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b6P59708 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b6P59708 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b6P59708 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b6P59708 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b6P59708 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b6P59708 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b6P59708 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b6P59708 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b6P59708 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b6P59708 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b6P59708 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b6P59708 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b6P59708 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b6P59708 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b6P59708 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b6P59708 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b6P59708 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3b6P59708 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3b6P59708 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b6P59708 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b6P59708 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b6P59708 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b6P59708 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sf3b6P59708 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b6P59708 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sf3b6P59708 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms