Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrn4P59383 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrn4P59383 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrn4P59383 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrn4P59383 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrn4P59383 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrn4P59383 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrn4P59383 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrn4P59383 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrn4P59383 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrn4P59383 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrn4P59383 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrn4P59383 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrn4P59383 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrn4P59383 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrn4P59383 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrn4P59383 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrn4P59383 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrn4P59383 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrn4P59383 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrn4P59383 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrn4P59383 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrn4P59383 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrn4P59383 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrn4P59383 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrn4P59383 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms