Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tpm2P58774 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Tpm2P58774 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tpm2P58774 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tpm2P58774 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tpm2P58774 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tpm2P58774 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tpm2P58774 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tpm2P58774 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tpm2P58774 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tpm2P58774 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tpm2P58774 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Tpm2P58774 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tpm2P58774 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tpm2P58774 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tpm2P58774 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tpm2P58774 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tpm2P58774 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tpm2P58774 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tpm2P58774 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tpm2P58774 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tpm2P58774 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tpm2P58774 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tpm2P58774 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tpm2P58774 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tpm2P58774 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tpm2P58774 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tpm2P58774 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tpm2P58774 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tpm2P58774 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tpm2P58774 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tpm2P58774 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tpm2P58774 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tpm2P58774 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tpm2P58774 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tpm2P58774 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tpm2P58774 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tpm2P58774 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tpm2P58774 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tpm2P58774 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tpm2P58774 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tpm2P58774 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tpm2P58774 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tpm2P58774 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tpm2P58774 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tpm2P58774 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tpm2P58774 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tpm2P58774 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tpm2P58774 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tpm2P58774 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tpm2P58774 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tpm2P58774 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tpm2P58774 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Tpm2P58774 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tpm2P58774 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Tpm2P58774 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tpm2P58774 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tpm2P58774 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tpm2P58774 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tpm2P58774 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tpm2P58774 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tpm2P58774 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tpm2P58774 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tpm2P58774 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tpm2P58774 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tpm2P58774 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tpm2P58774 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Tpm2P58774 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tpm2P58774 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tpm2P58774 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tpm2P58774 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tpm2P58774 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tpm2P58774 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tpm2P58774 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms