Protein–RNA interactions for Protein: P52623

Uck1, Uridine-cytidine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uck1P52623 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uck1P52623 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uck1P52623 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uck1P52623 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uck1P52623 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Uck1P52623 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uck1P52623 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Uck1P52623 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uck1P52623 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Uck1P52623 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Uck1P52623 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Uck1P52623 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uck1P52623 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uck1P52623 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Uck1P52623 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Uck1P52623 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Uck1P52623 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uck1P52623 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uck1P52623 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uck1P52623 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Uck1P52623 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uck1P52623 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uck1P52623 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uck1P52623 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Uck1P52623 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uck1P52623 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uck1P52623 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Uck1P52623 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uck1P52623 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Uck1P52623 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Uck1P52623 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Uck1P52623 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Uck1P52623 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uck1P52623 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uck1P52623 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uck1P52623 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Uck1P52623 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Uck1P52623 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uck1P52623 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Uck1P52623 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uck1P52623 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uck1P52623 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uck1P52623 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uck1P52623 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uck1P52623 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uck1P52623 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uck1P52623 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uck1P52623 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uck1P52623 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uck1P52623 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uck1P52623 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Uck1P52623 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Uck1P52623 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Uck1P52623 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Uck1P52623 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Uck1P52623 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Uck1P52623 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uck1P52623 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Uck1P52623 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uck1P52623 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Uck1P52623 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Uck1P52623 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uck1P52623 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uck1P52623 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uck1P52623 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uck1P52623 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uck1P52623 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uck1P52623 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uck1P52623 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uck1P52623 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uck1P52623 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uck1P52623 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms