Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccl9P51670 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl9P51670 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccl9P51670 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl9P51670 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl9P51670 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccl9P51670 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccl9P51670 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccl9P51670 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccl9P51670 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccl9P51670 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccl9P51670 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccl9P51670 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccl9P51670 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccl9P51670 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccl9P51670 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccl9P51670 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccl9P51670 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccl9P51670 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccl9P51670 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccl9P51670 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccl9P51670 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccl9P51670 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccl9P51670 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccl9P51670 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccl9P51670 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccl9P51670 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccl9P51670 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccl9P51670 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccl9P51670 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccl9P51670 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccl9P51670 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccl9P51670 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccl9P51670 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccl9P51670 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccl9P51670 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccl9P51670 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccl9P51670 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccl9P51670 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccl9P51670 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl9P51670 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccl9P51670 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccl9P51670 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccl9P51670 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccl9P51670 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccl9P51670 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccl9P51670 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccl9P51670 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccl9P51670 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccl9P51670 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl9P51670 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccl9P51670 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccl9P51670 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccl9P51670 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccl9P51670 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccl9P51670 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccl9P51670 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccl9P51670 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl9P51670 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl9P51670 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccl9P51670 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms