Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna7P49582 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chrna7P49582 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chrna7P49582 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chrna7P49582 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chrna7P49582 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chrna7P49582 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chrna7P49582 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chrna7P49582 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chrna7P49582 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chrna7P49582 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chrna7P49582 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna7P49582 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna7P49582 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna7P49582 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna7P49582 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna7P49582 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna7P49582 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna7P49582 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna7P49582 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna7P49582 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna7P49582 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna7P49582 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna7P49582 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna7P49582 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna7P49582 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna7P49582 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna7P49582 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna7P49582 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chrna7P49582 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chrna7P49582 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Chrna7P49582 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chrna7P49582 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chrna7P49582 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chrna7P49582 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna7P49582 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna7P49582 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna7P49582 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna7P49582 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna7P49582 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna7P49582 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna7P49582 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chrna7P49582 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chrna7P49582 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chrna7P49582 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chrna7P49582 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chrna7P49582 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chrna7P49582 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chrna7P49582 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chrna7P49582 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms