Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tacr3P47937 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tacr3P47937 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tacr3P47937 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tacr3P47937 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tacr3P47937 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tacr3P47937 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tacr3P47937 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tacr3P47937 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tacr3P47937 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tacr3P47937 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tacr3P47937 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tacr3P47937 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tacr3P47937 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tacr3P47937 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tacr3P47937 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tacr3P47937 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr3P47937 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tacr3P47937 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tacr3P47937 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tacr3P47937 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tacr3P47937 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tacr3P47937 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tacr3P47937 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tacr3P47937 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tacr3P47937 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tacr3P47937 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tacr3P47937 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tacr3P47937 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tacr3P47937 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tacr3P47937 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tacr3P47937 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tacr3P47937 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tacr3P47937 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tacr3P47937 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tacr3P47937 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tacr3P47937 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tacr3P47937 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tacr3P47937 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tacr3P47937 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tacr3P47937 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tacr3P47937 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tacr3P47937 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tacr3P47937 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tacr3P47937 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tacr3P47937 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tacr3P47937 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tacr3P47937 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tacr3P47937 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tacr3P47937 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tacr3P47937 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tacr3P47937 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tacr3P47937 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tacr3P47937 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms