Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pax7P47239 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pax7P47239 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pax7P47239 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pax7P47239 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pax7P47239 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pax7P47239 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pax7P47239 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pax7P47239 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pax7P47239 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pax7P47239 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pax7P47239 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pax7P47239 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pax7P47239 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pax7P47239 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pax7P47239 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pax7P47239 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pax7P47239 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pax7P47239 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pax7P47239 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pax7P47239 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pax7P47239 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pax7P47239 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pax7P47239 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pax7P47239 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pax7P47239 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pax7P47239 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pax7P47239 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pax7P47239 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pax7P47239 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pax7P47239 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pax7P47239 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pax7P47239 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pax7P47239 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pax7P47239 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pax7P47239 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pax7P47239 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pax7P47239 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pax7P47239 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pax7P47239 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pax7P47239 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pax7P47239 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pax7P47239 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pax7P47239 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pax7P47239 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pax7P47239 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pax7P47239 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pax7P47239 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pax7P47239 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pax7P47239 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pax7P47239 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pax7P47239 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pax7P47239 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pax7P47239 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pax7P47239 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pax7P47239 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pax7P47239 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pax7P47239 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pax7P47239 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pax7P47239 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pax7P47239 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax7P47239 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pax7P47239 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pax7P47239 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pax7P47239 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax7P47239 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pax7P47239 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms