Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec3bP43025 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec3bP43025 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec3bP43025 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clec3bP43025 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clec3bP43025 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clec3bP43025 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec3bP43025 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clec3bP43025 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clec3bP43025 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec3bP43025 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clec3bP43025 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec3bP43025 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec3bP43025 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec3bP43025 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec3bP43025 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clec3bP43025 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clec3bP43025 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec3bP43025 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec3bP43025 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec3bP43025 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec3bP43025 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Clec3bP43025 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clec3bP43025 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clec3bP43025 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec3bP43025 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec3bP43025 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec3bP43025 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec3bP43025 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec3bP43025 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms