Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nkx2-5P42582 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nkx2-5P42582 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx2-5P42582 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nkx2-5P42582 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx2-5P42582 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx2-5P42582 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx2-5P42582 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx2-5P42582 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nkx2-5P42582 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx2-5P42582 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx2-5P42582 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx2-5P42582 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nkx2-5P42582 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-5P42582 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-5P42582 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx2-5P42582 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx2-5P42582 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nkx2-5P42582 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx2-5P42582 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx2-5P42582 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nkx2-5P42582 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx2-5P42582 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx2-5P42582 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx2-5P42582 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-5P42582 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx2-5P42582 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nkx2-5P42582 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-5P42582 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-5P42582 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nkx2-5P42582 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Nkx2-5P42582 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Nkx2-5P42582 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx2-5P42582 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nkx2-5P42582 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nkx2-5P42582 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nkx2-5P42582 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nkx2-5P42582 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nkx2-5P42582 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nkx2-5P42582 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nkx2-5P42582 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nkx2-5P42582 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx2-5P42582 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nkx2-5P42582 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nkx2-5P42582 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nkx2-5P42582 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nkx2-5P42582 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nkx2-5P42582 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nkx2-5P42582 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nkx2-5P42582 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx2-5P42582 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx2-5P42582 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx2-5P42582 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx2-5P42582 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx2-5P42582 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-5P42582 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx2-5P42582 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-5P42582 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nkx2-5P42582 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx2-5P42582 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nkx2-5P42582 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nkx2-5P42582 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nkx2-5P42582 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms