Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl28P41105 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl28P41105 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl28P41105 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl28P41105 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl28P41105 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl28P41105 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl28P41105 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl28P41105 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl28P41105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl28P41105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl28P41105 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl28P41105 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl28P41105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl28P41105 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl28P41105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl28P41105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl28P41105 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl28P41105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl28P41105 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl28P41105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl28P41105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl28P41105 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl28P41105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl28P41105 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl28P41105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl28P41105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl28P41105 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl28P41105 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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