Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab12P35283 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab12P35283 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab12P35283 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab12P35283 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab12P35283 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab12P35283 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab12P35283 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab12P35283 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab12P35283 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab12P35283 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab12P35283 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab12P35283 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab12P35283 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab12P35283 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab12P35283 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab12P35283 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab12P35283 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab12P35283 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab12P35283 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab12P35283 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rab12P35283 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab12P35283 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab12P35283 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab12P35283 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab12P35283 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab12P35283 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab12P35283 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab12P35283 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab12P35283 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab12P35283 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab12P35283 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab12P35283 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab12P35283 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab12P35283 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab12P35283 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab12P35283 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab12P35283 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab12P35283 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab12P35283 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab12P35283 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab12P35283 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab12P35283 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab12P35283 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab12P35283 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab12P35283 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab12P35283 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab12P35283 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab12P35283 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab12P35283 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab12P35283 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab12P35283 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab12P35283 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab12P35283 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab12P35283 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab12P35283 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab12P35283 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab12P35283 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab12P35283 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab12P35283 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab12P35283 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab12P35283 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rab12P35283 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab12P35283 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab12P35283 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab12P35283 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab12P35283 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab12P35283 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab12P35283 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab12P35283 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab12P35283 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab12P35283 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms