Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stfa3P35173 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stfa3P35173 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stfa3P35173 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stfa3P35173 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stfa3P35173 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stfa3P35173 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stfa3P35173 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stfa3P35173 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stfa3P35173 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stfa3P35173 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stfa3P35173 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stfa3P35173 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stfa3P35173 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stfa3P35173 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stfa3P35173 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stfa3P35173 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stfa3P35173 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stfa3P35173 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stfa3P35173 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stfa3P35173 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stfa3P35173 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stfa3P35173 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stfa3P35173 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stfa3P35173 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stfa3P35173 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stfa3P35173 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stfa3P35173 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stfa3P35173 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stfa3P35173 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stfa3P35173 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stfa3P35173 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stfa3P35173 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stfa3P35173 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stfa3P35173 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stfa3P35173 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stfa3P35173 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stfa3P35173 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stfa3P35173 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stfa3P35173 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa3P35173 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stfa3P35173 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms