Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tfap2aP34056 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tfap2aP34056 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tfap2aP34056 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tfap2aP34056 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tfap2aP34056 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tfap2aP34056 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tfap2aP34056 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tfap2aP34056 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tfap2aP34056 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tfap2aP34056 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tfap2aP34056 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfap2aP34056 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tfap2aP34056 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tfap2aP34056 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tfap2aP34056 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfap2aP34056 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tfap2aP34056 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfap2aP34056 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfap2aP34056 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2aP34056 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfap2aP34056 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfap2aP34056 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2aP34056 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfap2aP34056 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfap2aP34056 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfap2aP34056 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tfap2aP34056 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfap2aP34056 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tfap2aP34056 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tfap2aP34056 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tfap2aP34056 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfap2aP34056 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfap2aP34056 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfap2aP34056 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfap2aP34056 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfap2aP34056 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfap2aP34056 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tfap2aP34056 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tfap2aP34056 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms