Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prim2P33610 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim2P33610 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prim2P33610 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prim2P33610 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prim2P33610 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prim2P33610 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prim2P33610 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim2P33610 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim2P33610 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prim2P33610 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prim2P33610 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prim2P33610 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prim2P33610 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim2P33610 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prim2P33610 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prim2P33610 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Prim2P33610 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Prim2P33610 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prim2P33610 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prim2P33610 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prim2P33610 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim2P33610 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prim2P33610 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prim2P33610 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim2P33610 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prim2P33610 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prim2P33610 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prim2P33610 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prim2P33610 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim2P33610 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim2P33610 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prim2P33610 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Prim2P33610 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prim2P33610 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prim2P33610 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prim2P33610 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prim2P33610 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Prim2P33610 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prim2P33610 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prim2P33610 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim2P33610 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prim2P33610 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prim2P33610 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim2P33610 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prim2P33610 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim2P33610 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prim2P33610 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prim2P33610 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prim2P33610 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Prim2P33610 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prim2P33610 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim2P33610 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Prim2P33610 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prim2P33610 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prim2P33610 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim2P33610 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prim2P33610 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prim2P33610 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim2P33610 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prim2P33610 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim2P33610 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prim2P33610 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prim2P33610 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Prim2P33610 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim2P33610 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prim2P33610 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prim2P33610 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim2P33610 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prim2P33610 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim2P33610 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prim2P33610 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prim2P33610 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim2P33610 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prim2P33610 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prim2P33610 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prim2P33610 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prim2P33610 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prim2P33610 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Prim2P33610 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms