Protein–RNA interactions for Protein: P31648

Slc6a1, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a1P31648 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a1P31648 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a1P31648 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a1P31648 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a1P31648 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a1P31648 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a1P31648 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a1P31648 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a1P31648 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc6a1P31648 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc6a1P31648 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a1P31648 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc6a1P31648 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc6a1P31648 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a1P31648 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a1P31648 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc6a1P31648 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc6a1P31648 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a1P31648 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc6a1P31648 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc6a1P31648 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc6a1P31648 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a1P31648 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc6a1P31648 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc6a1P31648 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc6a1P31648 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc6a1P31648 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a1P31648 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a1P31648 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc6a1P31648 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a1P31648 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a1P31648 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a1P31648 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a1P31648 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a1P31648 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms