Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Defa5P28312 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Defa5P28312 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa5P28312 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Defa5P28312 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa5P28312 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa5P28312 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa5P28312 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa5P28312 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa5P28312 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Defa5P28312 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa5P28312 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Defa5P28312 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Defa5P28312 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa5P28312 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa5P28312 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa5P28312 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa5P28312 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa5P28312 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa5P28312 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa5P28312 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa5P28312 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa5P28312 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Defa5P28312 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Defa5P28312 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa5P28312 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa5P28312 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Defa5P28312 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Defa5P28312 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Defa5P28312 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa5P28312 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Defa5P28312 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Defa5P28312 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Defa5P28312 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Defa5P28312 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Defa5P28312 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Defa5P28312 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Defa5P28312 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms