Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccnd1P25322 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnd1P25322 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccnd1P25322 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccnd1P25322 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccnd1P25322 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccnd1P25322 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccnd1P25322 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccnd1P25322 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccnd1P25322 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccnd1P25322 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccnd1P25322 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccnd1P25322 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccnd1P25322 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccnd1P25322 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccnd1P25322 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccnd1P25322 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnd1P25322 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnd1P25322 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnd1P25322 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnd1P25322 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnd1P25322 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnd1P25322 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnd1P25322 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnd1P25322 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd1P25322 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd1P25322 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd1P25322 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd1P25322 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccnd1P25322 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccnd1P25322 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnd1P25322 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccnd1P25322 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd1P25322 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccnd1P25322 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccnd1P25322 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccnd1P25322 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccnd1P25322 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccnd1P25322 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccnd1P25322 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccnd1P25322 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccnd1P25322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnd1P25322 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnd1P25322 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnd1P25322 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnd1P25322 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd1P25322 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd1P25322 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd1P25322 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd1P25322 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd1P25322 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd1P25322 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd1P25322 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd1P25322 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd1P25322 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd1P25322 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms