Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
P18533 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
P18533 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
P18533 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P18533 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P18533 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
P18533 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P18533 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P18533 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P18533 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
P18533 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
P18533 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
P18533 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
P18533 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
P18533 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
P18533 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
P18533 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
P18533 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P18533 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
P18533 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P18533 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P18533 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P18533 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P18533 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P18533 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P18533 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P18533 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P18533 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P18533 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P18533 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
P18533 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P18533 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P18533 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P18533 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
P18533 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P18533 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P18533 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P18533 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
P18533 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
P18533 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P18533 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
P18533 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P18533 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P18533 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
P18533 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P18533 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
P18533 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
P18533 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P18533 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P18533 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
P18533 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
P18533 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P18533 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
P18533 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P18533 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P18533 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P18533 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
P18533 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P18533 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
P18533 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P18533 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
P18533 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P18533 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
P18533 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P18533 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P18533 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P18533 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P18533 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P18533 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P18533 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P18533 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
P18533 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P18533 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P18533 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P18533 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P18533 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P18533 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
P18533 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
P18533 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P18533 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P18533 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P18533 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P18533 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
P18533 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P18533 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P18533 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
P18533 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
P18533 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
P18533 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
P18533 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
P18533 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P18533 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
P18533 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P18533 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P18533 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P18533 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P18533 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P18533 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P18533 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P18533 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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