Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P18528 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18528 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P18528 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P18528 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P18528 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P18528 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P18528 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P18528 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18528 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P18528 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
P18528 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P18528 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18528 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P18528 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P18528 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P18528 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P18528 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P18528 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
P18528 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18528 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18528 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P18528 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18528 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
P18528 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18528 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
P18528 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18528 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18528 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18528 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18528 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18528 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18528 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P18528 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18528 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P18528 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18528 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18528 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P18528 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P18528 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18528 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
P18528 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P18528 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P18528 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P18528 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18528 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P18528 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P18528 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18528 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P18528 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P18528 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18528 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18528 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P18528 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P18528 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P18528 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P18528 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P18528 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P18528 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P18528 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
P18528 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P18528 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P18528 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18528 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18528 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18528 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18528 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
P18528 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18528 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P18528 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P18528 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P18528 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18528 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18528 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18528 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18528 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18528 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P18528 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P18528 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18528 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P18528 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P18528 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18528 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18528 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P18528 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18528 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
P18528 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18528 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P18528 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18528 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18528 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18528 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
P18528 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18528 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
P18528 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
P18528 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18528 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
P18528 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
P18528 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
P18528 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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