Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SellP18337 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SellP18337 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SellP18337 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SellP18337 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SellP18337 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SellP18337 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SellP18337 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SellP18337 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SellP18337 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SellP18337 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SellP18337 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SellP18337 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SellP18337 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SellP18337 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SellP18337 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SellP18337 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SellP18337 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SellP18337 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SellP18337 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SellP18337 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SellP18337 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SellP18337 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SellP18337 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SellP18337 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SellP18337 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SellP18337 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SellP18337 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SellP18337 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SellP18337 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SellP18337 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SellP18337 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SellP18337 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SellP18337 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SellP18337 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SellP18337 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SellP18337 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SellP18337 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SellP18337 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SellP18337 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SellP18337 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SellP18337 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SellP18337 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SellP18337 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SellP18337 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SellP18337 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SellP18337 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SellP18337 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SellP18337 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SellP18337 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SellP18337 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SellP18337 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SellP18337 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SellP18337 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SellP18337 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SellP18337 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SellP18337 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SellP18337 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SellP18337 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SellP18337 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SellP18337 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SellP18337 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SellP18337 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SellP18337 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SellP18337 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SellP18337 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SellP18337 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SellP18337 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SellP18337 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SellP18337 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SellP18337 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SellP18337 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SellP18337 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SellP18337 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SellP18337 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SellP18337 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SellP18337 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SellP18337 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SellP18337 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SellP18337 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SellP18337 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SellP18337 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SellP18337 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SellP18337 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SellP18337 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SellP18337 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SellP18337 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SellP18337 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SellP18337 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SellP18337 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SellP18337 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SellP18337 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SellP18337 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SellP18337 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SellP18337 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SellP18337 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SellP18337 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SellP18337 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SellP18337 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SellP18337 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms