Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ass1P16460 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ass1P16460 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ass1P16460 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ass1P16460 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ass1P16460 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ass1P16460 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ass1P16460 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ass1P16460 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ass1P16460 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ass1P16460 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ass1P16460 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ass1P16460 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ass1P16460 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ass1P16460 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ass1P16460 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ass1P16460 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ass1P16460 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ass1P16460 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ass1P16460 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ass1P16460 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ass1P16460 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ass1P16460 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ass1P16460 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ass1P16460 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ass1P16460 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ass1P16460 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ass1P16460 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ass1P16460 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ass1P16460 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ass1P16460 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ass1P16460 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ass1P16460 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ass1P16460 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ass1P16460 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ass1P16460 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ass1P16460 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ass1P16460 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ass1P16460 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ass1P16460 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ass1P16460 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ass1P16460 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ass1P16460 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ass1P16460 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ass1P16460 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ass1P16460 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ass1P16460 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ass1P16460 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ass1P16460 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ass1P16460 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ass1P16460 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ass1P16460 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ass1P16460 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ass1P16460 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ass1P16460 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ass1P16460 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ass1P16460 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ass1P16460 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ass1P16460 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ass1P16460 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ass1P16460 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ass1P16460 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ass1P16460 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ass1P16460 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ass1P16460 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ass1P16460 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ass1P16460 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ass1P16460 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ass1P16460 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ass1P16460 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ass1P16460 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ass1P16460 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ass1P16460 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ass1P16460 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ass1P16460 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ass1P16460 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ass1P16460 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms