Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rag1P15919 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rag1P15919 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rag1P15919 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rag1P15919 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rag1P15919 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rag1P15919 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rag1P15919 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rag1P15919 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rag1P15919 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rag1P15919 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rag1P15919 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rag1P15919 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rag1P15919 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rag1P15919 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rag1P15919 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rag1P15919 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rag1P15919 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rag1P15919 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rag1P15919 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Rag1P15919 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rag1P15919 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rag1P15919 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rag1P15919 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rag1P15919 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rag1P15919 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rag1P15919 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rag1P15919 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rag1P15919 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rag1P15919 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rag1P15919 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rag1P15919 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rag1P15919 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rag1P15919 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rag1P15919 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rag1P15919 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rag1P15919 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rag1P15919 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rag1P15919 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rag1P15919 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rag1P15919 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rag1P15919 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rag1P15919 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rag1P15919 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rag1P15919 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rag1P15919 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rag1P15919 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rag1P15919 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rag1P15919 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rag1P15919 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rag1P15919 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rag1P15919 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rag1P15919 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rag1P15919 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rag1P15919 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rag1P15919 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rag1P15919 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rag1P15919 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rag1P15919 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rag1P15919 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rag1P15919 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rag1P15919 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rag1P15919 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rag1P15919 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rag1P15919 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms