Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Trim30aP15533 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Trim30aP15533 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim30aP15533 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim30aP15533 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim30aP15533 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim30aP15533 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trim30aP15533 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trim30aP15533 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trim30aP15533 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trim30aP15533 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trim30aP15533 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trim30aP15533 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trim30aP15533 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trim30aP15533 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim30aP15533 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim30aP15533 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim30aP15533 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim30aP15533 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim30aP15533 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim30aP15533 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim30aP15533 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim30aP15533 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim30aP15533 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim30aP15533 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms