Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2-D1P14427 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-D1P14427 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H2-D1P14427 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2-D1P14427 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H2-D1P14427 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-D1P14427 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2-D1P14427 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2-D1P14427 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2-D1P14427 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2-D1P14427 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2-D1P14427 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-D1P14427 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-D1P14427 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2-D1P14427 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2-D1P14427 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2-D1P14427 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-D1P14427 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2-D1P14427 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H2-D1P14427 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H2-D1P14427 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H2-D1P14427 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-D1P14427 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H2-D1P14427 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-D1P14427 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-D1P14427 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H2-D1P14427 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H2-D1P14427 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-D1P14427 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-D1P14427 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-D1P14427 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-D1P14427 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2-D1P14427 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-D1P14427 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-D1P14427 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-D1P14427 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-D1P14427 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
H2-D1P14427 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-D1P14427 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-D1P14427 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-D1P14427 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-D1P14427 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2-D1P14427 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2-D1P14427 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-D1P14427 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-D1P14427 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-D1P14427 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-D1P14427 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms