Protein–RNA interactions for Protein: P12849

Prkar1b, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1bP12849 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prkar1bP12849 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkar1bP12849 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkar1bP12849 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkar1bP12849 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkar1bP12849 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkar1bP12849 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkar1bP12849 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkar1bP12849 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkar1bP12849 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkar1bP12849 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkar1bP12849 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkar1bP12849 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkar1bP12849 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkar1bP12849 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prkar1bP12849 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkar1bP12849 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkar1bP12849 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkar1bP12849 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkar1bP12849 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkar1bP12849 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkar1bP12849 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkar1bP12849 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkar1bP12849 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkar1bP12849 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkar1bP12849 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkar1bP12849 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkar1bP12849 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkar1bP12849 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkar1bP12849 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkar1bP12849 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkar1bP12849 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkar1bP12849 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkar1bP12849 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkar1bP12849 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkar1bP12849 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkar1bP12849 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkar1bP12849 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkar1bP12849 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkar1bP12849 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkar1bP12849 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkar1bP12849 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkar1bP12849 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkar1bP12849 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkar1bP12849 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkar1bP12849 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkar1bP12849 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkar1bP12849 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prkar1bP12849 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prkar1bP12849 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms