Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Krt8P11679 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Krt8P11679 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt8P11679 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Krt8P11679 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt8P11679 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Krt8P11679 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Krt8P11679 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Krt8P11679 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt8P11679 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt8P11679 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Krt8P11679 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt8P11679 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt8P11679 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Krt8P11679 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Krt8P11679 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt8P11679 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt8P11679 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt8P11679 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt8P11679 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt8P11679 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt8P11679 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt8P11679 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt8P11679 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt8P11679 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt8P11679 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt8P11679 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Krt8P11679 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Krt8P11679 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Krt8P11679 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt8P11679 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt8P11679 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt8P11679 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt8P11679 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt8P11679 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt8P11679 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt8P11679 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt8P11679 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt8P11679 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt8P11679 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt8P11679 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt8P11679 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt8P11679 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt8P11679 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt8P11679 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt8P11679 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt8P11679 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt8P11679 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt8P11679 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt8P11679 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt8P11679 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt8P11679 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt8P11679 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt8P11679 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt8P11679 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms