Protein–RNA interactions for Protein: P11610

Cd1d2, Antigen-presenting glycoprotein CD1d2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d2P11610 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd1d2P11610 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd1d2P11610 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd1d2P11610 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd1d2P11610 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd1d2P11610 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd1d2P11610 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd1d2P11610 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd1d2P11610 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd1d2P11610 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd1d2P11610 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd1d2P11610 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd1d2P11610 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd1d2P11610 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd1d2P11610 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd1d2P11610 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd1d2P11610 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd1d2P11610 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd1d2P11610 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd1d2P11610 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd1d2P11610 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd1d2P11610 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d2P11610 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd1d2P11610 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd1d2P11610 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd1d2P11610 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd1d2P11610 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd1d2P11610 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd1d2P11610 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd1d2P11610 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd1d2P11610 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd1d2P11610 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd1d2P11610 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd1d2P11610 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d2P11610 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d2P11610 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d2P11610 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd1d2P11610 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd1d2P11610 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd1d2P11610 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd1d2P11610 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms