Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd1d1P11609 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd1d1P11609 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd1d1P11609 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd1d1P11609 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd1d1P11609 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd1d1P11609 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd1d1P11609 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cd1d1P11609 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd1d1P11609 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd1d1P11609 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd1d1P11609 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd1d1P11609 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd1d1P11609 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd1d1P11609 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd1d1P11609 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd1d1P11609 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd1d1P11609 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd1d1P11609 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd1d1P11609 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd1d1P11609 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd1d1P11609 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd1d1P11609 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd1d1P11609 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd1d1P11609 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd1d1P11609 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd1d1P11609 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd1d1P11609 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd1d1P11609 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd1d1P11609 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd1d1P11609 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd1d1P11609 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd1d1P11609 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd1d1P11609 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d1P11609 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d1P11609 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd1d1P11609 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd1d1P11609 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd1d1P11609 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd1d1P11609 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd1d1P11609 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms