Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pax1P09084 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pax1P09084 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pax1P09084 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pax1P09084 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pax1P09084 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pax1P09084 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pax1P09084 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pax1P09084 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pax1P09084 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pax1P09084 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pax1P09084 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax1P09084 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pax1P09084 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pax1P09084 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax1P09084 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax1P09084 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pax1P09084 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pax1P09084 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pax1P09084 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pax1P09084 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax1P09084 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax1P09084 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pax1P09084 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax1P09084 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax1P09084 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax1P09084 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax1P09084 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pax1P09084 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax1P09084 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax1P09084 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax1P09084 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax1P09084 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax1P09084 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pax1P09084 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax1P09084 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax1P09084 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax1P09084 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax1P09084 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax1P09084 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax1P09084 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax1P09084 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax1P09084 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax1P09084 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax1P09084 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax1P09084 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax1P09084 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax1P09084 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax1P09084 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax1P09084 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax1P09084 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pax1P09084 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax1P09084 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax1P09084 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax1P09084 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax1P09084 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax1P09084 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax1P09084 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Pax1P09084 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax1P09084 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pax1P09084 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pax1P09084 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pax1P09084 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pax1P09084 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms