Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxb5P09079 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxb5P09079 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hoxb5P09079 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxb5P09079 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxb5P09079 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxb5P09079 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb5P09079 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxb5P09079 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb5P09079 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb5P09079 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb5P09079 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb5P09079 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb5P09079 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb5P09079 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb5P09079 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb5P09079 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb5P09079 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb5P09079 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb5P09079 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb5P09079 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb5P09079 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb5P09079 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb5P09079 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb5P09079 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb5P09079 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb5P09079 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb5P09079 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb5P09079 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb5P09079 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb5P09079 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb5P09079 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb5P09079 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb5P09079 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb5P09079 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxb5P09079 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxb5P09079 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxb5P09079 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb5P09079 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxb5P09079 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb5P09079 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxb5P09079 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxb5P09079 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb5P09079 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxb5P09079 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.4 ms