Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifna4P07351 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifna4P07351 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifna4P07351 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifna4P07351 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifna4P07351 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifna4P07351 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifna4P07351 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna4P07351 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifna4P07351 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifna4P07351 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifna4P07351 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna4P07351 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifna4P07351 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna4P07351 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifna4P07351 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifna4P07351 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifna4P07351 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ifna4P07351 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna4P07351 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna4P07351 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifna4P07351 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna4P07351 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna4P07351 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifna4P07351 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifna4P07351 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifna4P07351 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna4P07351 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna4P07351 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna4P07351 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifna4P07351 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna4P07351 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna4P07351 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna4P07351 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna4P07351 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna4P07351 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna4P07351 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifna4P07351 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna4P07351 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifna4P07351 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifna4P07351 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifna4P07351 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifna4P07351 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna4P07351 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna4P07351 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390 ms